Se calcula por peso y dimensiones?

Si, realiza el cálculo de precio dependiendo del tama?o y peso de los productos que el usuario desea comprar, ubicación de origen de los productos (desde donde despachas, eso lo configura c/u en su tienda) y el destino (donde el comprador desea que los productos sean despachados).
Puedes ver el algoritmo del cálculo acá https://github.com/whooohq/whq-woocommerce-chilexpress-shipping/blob/master/classes/WC_WHQ_Chilexpress_Shipping.php lineas 177 a la 375.

Se utiliza la API de Chilexpress, directamente, por lo que (en teoría) el costo del envío es lo mismo que calcularlo acá a mano https://www.chilexpress.cl/cotizador-envios-de-encomiendas-tarifas
Si en agencia utilizan el mismo valor (y espero, si no no tendría sentido que Chilexpress tuviese una API para esto), no debería haber diferencia. Esa es la idea del plugin ??

Si Starken tiene una API pública, podríamos hacer algo similar. El pero es que no se si tienen una API como la que Chilexpress provee.
Sin ella, es difícil hacer algo así.
Existe un plugin que hace algo similar con Starken https://cl.www.ads-software.com/plugins/calculo-de-despacho-via-starken-para-woocommerce/ pero usan una API privada. Ignoro de donde obtuvieron aquel acceso. Puedes probar si te sirve.

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