料金の計算などの挙動について

現在の設定だと３月２８日以降は部屋料金とゲストの追加料金がかかる計算になります。

上記の日付以降のスケジュールをBooking Package > カレンダー設定 > 対象のカレンダーのスケジュール設定のカレンダーより確認を行ってください。おそらく各日に料金が設定されていると思われます。
各スケジュールに設定されている料金は、そのカレンダーの設定タブ内の各曜日の料金が反映されます。

早速のご返事ありがとうございます。

対象カレンダーのスケジュール設定は一括で変更するにはどうすればいいのでしょうか？

一括で変更する方法はありません。
対象のカレンダーのスケジュールタブ内のカレンダーの初日から月末までを選択して、「スケジュールを編集」ボタンを押すと、その範囲のスケジュールが表示されます。