Dejar wp-content y eliminar wp-includes y wp-admin cambiando por una copia nueva

Buenas tardes, tenia un problema en la web que habia resultado infectada con codigo malicioso por hack y lo ahora me sale el error de la base de datos al eliminar wp-includes y wp-admin ya que los remplace por una copia nueva de wordpress,manteniendo el wp-content tal cual como estaba.
El hack no es lo que provoca ese error,me sale a partir de eliminar esos dos archivos y hacer la reinstalacion parcial de wordpress (includes y wp-admin)
Es decir, en public html sigue estando el wp-content antiguo y el wp-admin y wp-includes son nuevos(los antiguos se eliminaron) Donde puede estar el problema?

Gracias.